bio-atac-seq-atac-peak-calling

Name: bio-atac-seq-atac-peak-calling
Rating: 5 (1 reviews)
Author: bg-szy

Call accessible chromatin regions from ATAC-seq BAM files using MACS3, MACS2, Genrich, or HMMRATAC. Use when identifying open chromatin from aligned ATAC-seq, choosing between point-source vs HMM peak callers, applying ENCODE-style pseudoreplicate IDR, removing blacklist regions, or fixing 501bp consensus peaks for downstream differential analysis.

1estrelas

Atualizado há 18 dias

Ver no GitHub ↗

Como adicionar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

Para o autor da skill

Cole no README do seu repo

Mostra que sua skill está catalogada na Skillteca, gera backlink e tráfego rastreável.

[![Listada na Skillteca](https://www.skillteca.com.br/api/badge/bio-atac-seq-atac-peak-calling/svg)](https://www.skillteca.com.br/skills/bio-atac-seq-atac-peak-calling?utm_source=badge&utm_medium=readme&utm_campaign=badge)

Skills relacionadas

Ver todas de Pesquisa e Web →

dev-browser

60.3k

Automatiza interações do navegador com estado de página persistente. Utilize para navegar em sites, preencher formulários, tirar capturas de tela, extrair dados da web, testar aplicativos ou automatizar fluxos de trabalho do navegador.

Pesquisa e Web#testpor code-yeongyu

agent-browser

55.6k

Browser automation CLI for AI agents. Use when the user needs to interact with websites, including navigating pages, filling forms, clicking buttons, taking screenshots, extracting data, testing web apps, or automating any browser task. Triggers include requests to "open a website", "fill out a form", "click a button", "take a screenshot", "scrape data from a page", "test this web app", "login to

Pesquisa e Web#ai#testpor shanraisshan

understand-chat

45.5k

Use quando precisar fazer perguntas sobre uma base de código ou entender código usando um grafo de conhecimento.

Pesquisa e Webpor Lum1104

understand-dashboard

45.5k

Lance o painel web interativo para visualizar o grafo de conhecimento de uma base de código.

Pesquisa e Webpor Lum1104

Alerta por categoria

Receba novas skills de Pesquisa e Web toda segunda

1 email curto, só com as skills novas de Pesquisa e Web. 4 minutos de leitura, sem spam, cancela com 1 clique.

Você confirma o email no primeiro envio. Sem spam. Cancela com 1 clique.

Version Compatibility

Reference examples tested with: MACS3 3.0.2+, MACS2 2.2.9+, Genrich 0.6.1+, HMMRATAC 1.2+ (now bundled in MACS3 as macs3 hmmratac), samtools 1.19+, bedtools 2.31+, IDR 2.0.4+.

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws unexpected errors, introspect the installed binary (<tool> -h) and adapt the example to match the actual CLI rather than retrying.

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

CompartilharX LinkedIn

Comentários · Nenhum comentário

Entre para comentar. Entrar

Ainda não há comentários. Seja o primeiro.