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bio-clip-seq-clip-alignment

Align preprocessed CLIP-seq reads (eCLIP, iCLIP, iCLIP2, PAR-CLIP) to genome with STAR or bowtie2 using crosslink-preserving parameters, choosing between unique-mapper-only and multi-mapper-aware alignment for repeat-binding RBPs, deciding STAR vs HISAT2 memory trade-offs, and applying ENCODE-compatible filters. Use when turning preprocessed CLIP FASTQ into a deduplicated, MAPQ-filtered BAM ready

1estrellas
Actualizado hace 14 días

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Cómo agregar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

El comando exacto puede variar según el repositorio. Consulta el README en GitHub.

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[![Listada na Skillteca](https://www.skillteca.com.br/api/badge/bio-clip-seq-clip-alignment-bg-szy/svg)](https://www.skillteca.com.br/skills/bio-clip-seq-clip-alignment-bg-szy?utm_source=badge&utm_medium=readme&utm_campaign=badge)

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