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bio-clip-seq-clip-peak-calling

Call protein-RNA binding sites from CLIP-seq BAM with CLIPper, PureCLIP, Skipper, Piranha, omniCLIP, CTK, CLAM, or Paraclu. Use when choosing between coverage-based, HMM-based, beta-binomial window-based, and crosslink-site-based peak callers; applying ENCODE eCLIP thresholds (log2 IP/SMInput >= 3, -log10 p >= 3); deciding when SMInput is mandatory; or reconciling peak-set discordance between call

1estrellas
Actualizado hace 14 días

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Cómo agregar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

El comando exacto puede variar según el repositorio. Consulta el README en GitHub.

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[![Listada na Skillteca](https://www.skillteca.com.br/api/badge/bio-clip-seq-clip-peak-calling-bg-szy/svg)](https://www.skillteca.com.br/skills/bio-clip-seq-clip-peak-calling-bg-szy?utm_source=badge&utm_medium=readme&utm_campaign=badge)

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