bio-flow-cytometry-bead-normalization

Name: bio-flow-cytometry-bead-normalization
Rating: 5 (1 reviews)
Author: bg-szy

Bead-based signal normalization and cross-batch harmonization for CyTOF and high-parameter cytometry - EQ four-element bead normalization of instrument sensitivity drift (CATALYST normCytof, premessa), and reference-anchor cross-batch normalization (CytoNorm, per-cluster quantile splines). Covers the distinction between within-run drift correction and between-batch correction, the mandatory anchor

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Actualizado hace 14 días

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Reference examples tested with: CATALYST 1.26+, CytoNorm 2.0+, flowCore 2.14+.

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters

normCytof() returns a LIST ($data, $beads, $removed, ...), not a flowFrame; beads="dvs" encodes EQ masses 140,151,153,165,175. Confirm with ?normCytof before relying on slot names.

Bead Normalization

**"Normalize my CyTOF

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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