bio-genome-assembly-long-read-assembly

Name: bio-genome-assembly-long-read-assembly
Rating: 5 (1 reviews)
Author: bg-szy

Assembles genomes de novo from noisy long reads (Oxford Nanopore R9/R10/Dorado, PacBio CLR) with Flye (repeat graph), Canu (correct-trim-assemble OLC), NextDenovo, Shasta, Raven, wtdbg2, or miniasm, and reconciles bacterial assemblies into a consensus with Trycycler/Autocycler. Covers matching the input flag to the basecaller era (--nano-hq vs --nano-raw), why a raw long-read assembly is contiguou

1estrellas

Actualizado hace 13 días

Ver en GitHub ↗

Cómo agregar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

El comando exacto puede variar según el repositorio. Consulta el README en GitHub.

Para el autor de la skill

Pega en el README de tu repo

Muestra que tu skill está catalogada en Skillteca, genera backlink y tráfico rastreable.

[![Listada na Skillteca](https://www.skillteca.com.br/api/badge/bio-genome-assembly-long-read-assembly-bg-szy/svg)](https://www.skillteca.com.br/skills/bio-genome-assembly-long-read-assembly-bg-szy?utm_source=badge&utm_medium=readme&utm_campaign=badge)

Skills relacionadas

Ver todas de Marketing →

learn-codebase

79.7k

Prepara una base de código leyendo cada archivo fuente por completo. Úsalo al iniciar un proyecto nuevo o desconocido, o cuando el usuario solicite "aprender la base de código", "leer la base de código", "preparar" o "ponerse al día".

Marketing#aipor thedotmack

remove-deadcode

60.3k

Elimina código no utilizado de este proyecto con modo ultrawork, seguridad verificada por LSP y commits atómicos. Disparadores: eliminar código muerto, limpieza, eliminar no utilizado.

Marketingpor code-yeongyu

sendgrid-automation

39.2k

Automate SendGrid email delivery workflows including marketing campaigns (Single Sends), contact and list management, sender identity setup, and email analytics through Composio's SendGrid toolkit.

Marketing#github#gitpor sickn33

seo

39.2k

Run a broad SEO audit across technical SEO, on-page SEO, schema, sitemaps, content quality, AI search readiness, and GEO. Use as the umbrella skill when the user asks for a full SEO analysis or strategy.

Marketing#seo#githubpor sickn33

Alerta por categoría

Recibe nuevas skills de Marketing todos los lunes

Un email corto con solo las skills nuevas de Marketing. 4 minutos de lectura, sin spam, te das de baja con un clic.

Confirmas tu email en el primer envío. Sin spam. Te das de baja con un clic.

Version Compatibility

Reference examples tested with: Flye 2.9+, Canu 2.2+, NextDenovo 2.5+, Shasta 0.11+, Raven 1.8+, wtdbg2 2.5+, miniasm 0.3+, minimap2 2.26+, purge_dups 1.2+, Porechop_ABI 0.5+, Trycycler 0.5+.

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

Two behaviors are version-dependent and load-bearing: Flye --genome-size became optional (auto-estimated) and --scaffold flipped OF

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

CompartirX LinkedIn

Comentarios · Sin comentarios

Entra para comentar. Entrar

Aún no hay comentarios. Sé el primero.