bio-rna-structure-secondary-structure-prediction

Name: bio-rna-structure-secondary-structure-prediction
Rating: 5 (1 reviews)
Author: bg-szy

Predicts RNA secondary structures using minimum free energy folding and partition function analysis with ViennaRNA (RNAfold, RNAalifold, RNAcofold). Computes base-pair probabilities, centroid structures, and consensus structures from alignments. Use when predicting RNA folding, evaluating structural stability, or comparing structures across homologs.

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Atualizado há 18 dias

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Reference examples tested with: Infernal 1.1+, matplotlib 3.8+, numpy 1.26+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures
CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Secondary

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