bio-workflows-longread-sv-pipeline

Name: bio-workflows-longread-sv-pipeline
Rating: 5 (1 reviews)
Author: bg-szy

End-to-end workflow for detecting structural variants from long-read sequencing data. Covers ONT/PacBio alignment with minimap2 and SV calling with Sniffles or cuteSV. Use when detecting structural variants from long reads.

1estrellas

Actualizado hace 14 días

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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Long-Read SV Pipeline

**"Detect structural variants from my long-read sequencing data

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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