Microbiome Pipeline
Pipeline Overview
Paired-End FASTQ (16S V4)
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[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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# COPYRIGHT NOTICE
# This file is part of the "Universal Biomedical Skills" project.
# Copyright (c) 2026 MD BABU MIA, PhD <md.babu.mia@mssm.edu>
# All Rights Reserved.
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# This code is proprietary and confidential.
# Unauthorized copying of this file, via any medium is strictly prohibited.
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# Provenance: Authenticated by MD BABU MIA
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bio-workflows-microbiome-pipeline
End-to-end 16S amplicon workflow from FASTQ reads to differential abundance. Orchestrates DADA2 ASV inference, taxonomy assignment, diversity analysis, and compositional testing with ALDEx2. Use when processing 16S/ITS amplicon data.
1estrelas
Atualizado há 15 dias
Como adicionar
/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS
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