Explorar skills

Esta skill orquesta el análisis completo de RNA-seq masivo, procesando lecturas FASTQ crudas desde el control de calidad y recorte hasta la alineación y cuantificación para ensamblar una matriz de recuentos a nivel de gen. Luego, realiza expresión diferencial, enriquecimiento de vías y genera figuras para publicación.

Esta habilidad es para tareas de aprendizaje automático con datos de intervalos genómicos (archivos BED), como el entrenamiento de incrustaciones de región (Region2Vec, BEDspace), análisis de ATAC-seq de célula única (scEmbed) o la construcción de picos de consenso. Se aplica a colecciones de archivos BED, datos de scATAC-seq y conjuntos de datos de accesibilidad de la cromatina.

Busque artículos científicos y recupere datos experimentales estructurados de estudios de texto completo a través del servidor BGPT MCP. Devuelve más de 25 campos por artículo, incluyendo métodos, resultados y conclusiones, útil para revisiones de literatura y para encontrar detalles experimentales más allá de los resúmenes.

Genere o edite imágenes utilizando modelos de IA (FLUX, Nano Banana 2). Úselo para la generación de imágenes de propósito general, incluyendo fotos, ilustraciones, arte y arte conceptual, pero no diagramas técnicos. Para diagramas técnicos, use la skill scientific-schematics.

Esta habilidad detecta e informa los recursos del sistema disponibles (núcleos de CPU, GPUs, memoria, espacio en disco) al inicio de tareas científicas computacionalmente intensivas. Genera un archivo JSON con información de recursos y recomendaciones estratégicas para guiar decisiones de enfoque computacional, como el uso de procesamiento paralelo o computación out-of-core.

Esta herramienta proporciona extracción y preprocesamiento ligero de teselas WSI, ideal para el procesamiento básico de portaobjetos, detección de tejido y normalización de tinción para imágenes H&E. Es óptima para pipelines simples, preparación de conjuntos de datos y análisis rápido basado en teselas, recomendándose pathml para aplicaciones avanzadas.

Framework de simulación de eventos discretos basado en procesos en Python. Utilice esta habilidad para construir simulaciones de sistemas con procesos, colas, recursos y eventos temporizados, como manufactura, servicios, tráfico de red y logística, donde las entidades interactúan con recursos compartidos.

Esta habilidad analiza grabaciones neuronales Neuropixels, incluyendo la carga de datos SpikeGLX/OpenEphys, preprocesamiento, corrección de movimiento, clasificación de picos con Kilosort4, métricas de calidad y análisis visual asistido por IA para electrofisiología extracelular Neuropixels 1.0/2.0.

Este kit de herramientas del operador soporta flujos de trabajo nf-core/pacsomatic de tumor-normal emparejados a partir de entradas BAM, permitiendo la validación, generación de samplesheets, preparación de artefactos de lanzamiento de Nextflow, ejecución local o en planificadores, y la clasificación de fallos de ejecución. Se activa con solicitudes para ejecutar pacsomatic o preparar comandos de lanzamiento.

Kit de herramientas para árboles filogenéticos (ETE) para filogenómica, que ofrece manipulación de árboles (Newick/NHX), detección de eventos evolutivos, análisis de ortología/paralogía, integración con taxonomía NCBI y visualización (PDF/SVG).

Kit de herramientas de quimioinformática para control molecular detallado, compatible con análisis SMILES/SDF, descriptores, huellas dactilares, búsqueda de subestructuras, generación 2D/3D, similitud y reacciones. Para flujos de trabajo estándar con una interfaz más sencilla, use datamol (un wrapper de RDKit); para control avanzado, sanitización personalizada o algoritmos especializados, use rdkit directamente.

Kit de herramientas para archivos genómicos, ideal para pipelines de procesamiento de datos NGS. Permite leer/escribir alineaciones SAM/BAM/CRAM, variantes VCF/BCF, secuencias FASTA/FASTQ, extraer regiones y calcular cobertura.