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ai-science-variant-to-structure-models

Da Variação de DNA à Estrutura Proteica: AlphaFold2, AlphaFold3, RoseTTAFold com NumPy

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Atualizado há 6 meses

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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

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From DNA Variants to Protein Structure: AlphaFold2, AlphaFold3, RoseTTAFold

Decision Framework

  1. Prioritize variants from genomic models (splice/expression/regulatory)
  2. Keep coding or coding-adjacent candidates
  3. Map to protein regions (domain, interface, active-site proximity)
  4. Run structural follow-up; assess confidence

Non-coding variants (splice, regulatory) rarely benefit from structure modeling. Save structural prediction for missense variants where mechanism depends on prote

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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