Receber por email
← Voltar para o catálogo

alphafold

"Validate protein designs using AlphaFold2 structure prediction. Use this skill when: (1) Validating designed sequences fold correctly, (2) Predicting binder-target complex structures, (3) Calculating confidence metrics (pLDDT, pTM, ipTM), (4) Self-consistency validation of designs, (5) Multi-chain complex prediction with AlphaFold-Multimer.

2estrelas
Atualizado há 4 meses

Ver no GitHub ↗

Como adicionar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

Para o autor da skill

Cole no README do seu repo

Mostra que sua skill está catalogada na Skillteca, gera backlink e tráfego rastreável.

[![Skillteca](https://www.skillteca.com.br/api/badge/alphafold/svg)](https://www.skillteca.com.br/skills/alphafold)
#ai

Alerta por categoria

Receba novas skills de Design e Frontend toda segunda

1 email curto, só com as skills novas de Design e Frontend. 4 minutos de leitura, sem spam, cancela com 1 clique.

Você confirma o email no primeiro envio. Sem spam. Cancela com 1 clique.

Ler descrição completa

AlphaFold2 Structure Validation

Prerequisites

| Requirement | Minimum | Recommended | |-------------|---------|-------------| | Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 12.0+ | | GPU VRAM | 32GB | 40GB (A100) | | RAM | 32GB | 64GB | | Disk | 100GB | 500GB (for databases) |

How to run

First time? See [Installation Guide](../../docs/installation.md) to set up Modal and biomodals.

Option 1: ColabFold (recommended for multimer)

cd biomodals
modal run modal_colabfold.py 

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
Compartilhar X LinkedIn