bio-alignment-multiple

Name: bio-alignment-multiple
Rating: 5 (1 reviews)
Author: bg-szy

Perform multiple sequence alignment using MAFFT, MUSCLE5, ClustalOmega, or T-Coffee. Guides tool and algorithm selection based on dataset size, sequence divergence, and downstream application. Use when aligning three or more homologous sequences for phylogenetics, conservation analysis, or evolutionary studies.

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Atualizado há 13 dias

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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Version Compatibility

Reference examples tested with: MAFFT 7.520+, MUSCLE 5.1+, ClustalOmega 1.2.4+, T-Coffee 13+, PAL2NAL 14+, BioPython 1.83+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

CLI: mafft --version, muscle -version, clustalo --version
Python: pip show biopython then help(module.function) to check signatures

If code throws errors, introspect the installed tool and adapt the example to match the actual CLI flags rather than retry

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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