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bio-alignment-trimming

Design e Frontend Autor: bg-szy

Trim multiple sequence alignments using ClipKIT, trimAl, BMGE, Divvier, or HMMcleaner with mode selection guidance per downstream goal. Use when removing unreliable columns or contaminating residues before phylogenetic inference, HMM building, or selection analysis.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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Version Compatibility

Reference examples tested with: ClipKIT 2.1+, trimAl 1.4+, BMGE 1.12+, Divvier 1.01+, HMMcleaner (current CPAN release of Bio::MUST::Apps::HmmCleaner), BioPython 1.83+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • CLI: clipkit --version, trimal --version, BMGE --help, Divvier --help
  • Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, int

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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