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Transcriptômica do câncer para classificação de subtipos de melanoma (Tirosh/Harbst), utilizando pipeline de pré-processamento, PCA/t-SNE, agrupamento hierárquico, random forest e análise de sobrevivência de Kaplan-Meier.
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Cancer Transcriptomics: Subtype Classification
Key References
Tirosh et al. (2016) Science — single-cell dissection of melanoma intratumoral heterogeneity Harbst et al. (2016) Clin Cancer Res — four molecular subtypes from bulk RNA-seq (TCGA-SKCM) Data: cBioPortal TCGA-SKCM
Melanoma Subtype Marker Genes
| Subtype | Key Markers | Classification | |---------|-------------|----------------| | Pigmentation (MITF-high) | MI
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