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Pipeline de ChIP-seq que inclui controle de qualidade, alinhamento, deduplicação, chamada de picos com MACS2 e normalização de sinal com deepTools.
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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics
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ChIP-seq Processing Pipeline
Experiment Design Reference
| Experiment Type | Peak Shape | Recommended Reads | Example Marks | |---|---|---|---| | TF | Narrow (< 500 bp) | 20-40 M | CTCF, GATA1, p53 | | Active histone | Narrow | 30-50 M | H3K4me3, H3K9ac | | Broad histone | Broad (> 5 kb) | 40-80
[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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