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bio-applied-genetic-engineering-in-silico

Digestão de restrição in silico, detecção de extremidades compatíveis, design de primers (modelos de Tm) e simulação de gel.

3estrelas
Atualizado há 6 meses

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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

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Genetic Engineering In Silico

Restriction Enzyme Reference

| Overhang type | Example | Note | |---------------|---------|------| | 5' sticky | EcoRI (GAATTC, cut 1/5) | Most common for cloning | | 3' sticky | KpnI (GGTACC, cut 5/1) | Less common | | Blunt | SmaI (CCCGGG, cut 3/3) | Ligation-inefficient |

Compatible end rule: same overhang sequence = ligatable (e.g. BamHI + BglII both give 5'-GATC).

Core Functions

import re

RESTRICTION_ENZYMES = {
    # name: (recognition_

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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