bio-applied-machine-learning-for-biology

Name: bio-applied-machine-learning-for-biology
Author: Pavel-Kravchenko

Desenvolvimento

Autor: Pavel-Kravchenko

Aprendizado de máquina em bioinformática, abordando engenharia de características para sequências, classificação de promotores, divisões de treino/teste, regressão logística, floresta aleatória e armadilhas bioespecíficas.

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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

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Machine Learning for Biology

ML Use Cases in Bioinformatics

| Application | Type | Key features | Tools | |-------------|------|-------------|-------| | Variant pathogenicity (CADD, REVEL) | Classification | Conservation, AF, protein impact | sklearn, XGBoost | | Promoter / regulatory element | Classification | k-mer freq, CpG O/E, TATA box | sklearn | | Cell type (scRNA-seq) | Clustering | Gene expression profiles | scanpy, sklearn | | Drug response | Regression/Classification | Gene exp

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