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bio-applied-mirna-seq-pipeline

Pipeline de miRNA-seq: remoção de adaptadores, alinhamento ao miRBase, quantificação, análise de expressão diferencial e previsão de alvos. Use ao processar dados de sequenciamento de pequenos RNAs.

3estrelas
Atualizado há 6 meses

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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

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miRNA-seq Processing and Analysis

miRNA Naming Convention

  • miR-21 / miR-21-5p: mature guide, 5' arm
  • miR-21-3p: 3' arm (was miR-21*)
  • hsa-miR-21-5p: human, 5' arm
  • mir-21 (lowercase): the gene/precursor

Seed region: positions 2-7 of mature miRNA, critical for target re

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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