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bio-applied-mofa2

MOFA2 é uma análise fatorial multi-ômica não supervisionada que realiza decomposição de variância, interpretação de fatores e separação de sinais compartilhados/específicos. É ideal para integrar múltiplas camadas ômicas.

3estrelas
Atualizado há 6 meses

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Como adicionar

/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

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MOFA2: Multi-Omics Factor Analysis

Generative Model

X_m = Z @ W_m.T + noise, for each omics view m.

  • Z (N x K): shared latent factors across views
  • W_m (D_m x K): view-specific feature weights

Usage

# Via mofapy2
from mofapy2.run.entry_point import entry_point
ent = entry_point()
ent.set_data_options(scale_groups=False, scale_views=True)
ent.set_

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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