Detecção de comunidades em redes biológicas usando algoritmos de Louvain/Leiden, modularidade Q, módulos de coexpressão WGCNA e exportação para Cytoscape.
/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics
O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.
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Recursos para auxiliar na redação de comunicações internas em diversos formatos preferidos pela empresa. Claude deve usar esta habilidade para criar relatórios de status, atualizações de liderança, newsletters, FAQs e outros documentos internos.
Monitora um pull request ou ciclo de revisão até que esteja pronto para ser mesclado. Ideal para acompanhar comentários, revisões e CI de PRs até a resolução de todos os problemas.
Execute um plano de implementação faseado usando subagentes. Use quando solicitado a executar, rodar ou levar a cabo um plano — especialmente um criado por make-plan.
Busca estrutural de código otimizada por tokens usando parsing AST do tree-sitter. Utilize para entender a estrutura do código, encontrar funções ou explorar uma base de código de forma eficiente, sem a necessidade de ler arquivos completos.
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| Algorithm | Complexity | Notes |
|---|---|---|
| Louvain | O(n log n) | Greedy modularity; can produce disconnected communities (bug) |
| Leiden | O(n log n) | Fixes Louvain bug; preferred for publication |
| Girvan-Newman | O(m²n) | Edge betweenness removal; slow, interpretable |
| Spectral clustering | O(n³) | Principled, no resolution limit |
| Infomap | O(m) | Best for directed networks |
[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
