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bio-applied-phylodynamics

Filodinâmica viral: relógios moleculares, regressão da raiz à ponta, filogenias escaladas no tempo, gráficos Bayesian skyline e seleção de ferramentas de filogeografia.

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Atualizado há 6 meses

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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

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Viral Phylodynamics and Molecular Epidemiology

Substitution Rates (Common Viruses)

| Virus | Rate (subs/site/year) | Notes | |-------|-----------------------|-------| | SARS-CoV-2 | ~1 × 10⁻³ | ~1–2 SNPs per 2 weeks | | Influenza A (HA) | 3–5 × 10⁻³ | High immune selection | | HIV-1 | 2–4 × 10⁻³ | Highest among RNA viruses | | Hepatitis C | 1–2 × 10⁻³ | Chronic, slow | | Measles | ~5 × 10⁻⁴ | More conserved |

Tool Selection

| Tool | Approach | Speed | Use Case | |------|----------|--

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