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bio-applied-promoter

Elementos promotores centrais: caixa TATA, ilhas CpG, construção de PWM e varredura de TFBS. Cartão de referência complementar para análise regulatória bioaplicada.

3estrelas
Atualizado há 6 meses

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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

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Core Promoter Elements

For full regulatory analysis including GRN context, see bio-applied-regulatory-analysis.

Promoter Architecture

| Element | Position | Notes | |---------|----------|-------| | TATA box | −25 to −35 | TATAAA consensus; ~10–20% of human genes | | Initiator (Inr) | +1 | Present in TATA-less promoters | | DPE | +28 to +32 | Downstream promoter element; compensates for absent TATA | | CpG island | −200 to +100 | ~70% of human promoters; mark of constitutive expressio

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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