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bio-applied-regulatory-analysis

Realiza análise de sequências promotoras e regulatórias, incluindo detecção de caixa TATA, varredura de ilhas CpG, construção de PWM/PFM e varredura de TFBS, sendo uma referência para análise computacional de promotores.

3estrelas
Atualizado há 6 meses

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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

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Promoter and Regulatory Sequence Analysis

Key Regulatory Elements

| Element | Location | Function | |---------|----------|----------| | Promoter | −1 to −1000 bp from TSS | Recruits RNA Pol II | | Enhancer | Distal (kb–Mb away) | Boosts transcription | | Silencer | Variable | Represses transcription | | Insulator | Between elements | Blocks enhancer–promoter crosstalk |

  • TSS = position +1; upstream = negative coordinates
  • TATA box: consensus TATAAA at ~−30; present in ~10–20% o

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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