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Realiza análise de sequências promotoras e regulatórias, incluindo detecção de caixa TATA, varredura de ilhas CpG, construção de PWM/PFM e varredura de TFBS, sendo uma referência para análise computacional de promotores.
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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics
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Promoter and Regulatory Sequence Analysis
Key Regulatory Elements
| Element | Location | Function | |---------|----------|----------| | Promoter | −1 to −1000 bp from TSS | Recruits RNA Pol II | | Enhancer | Distal (kb–Mb away) | Boosts transcription | | Silencer | Variable | Represses transcription | | Insulator | Between elements | Blocks enhancer–promoter crosstalk |
TSS = position +1; upstream = negative coordinatesTATA box : consensus TATAAA at ~−30; present in ~10–20% o
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