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Classificação de linhagens de SARS-CoV-2 (Pango), desconvolução de águas residuais com Freyja, rastreamento de mutações da proteína spike e ferramentas de pipeline de vigilância.
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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics
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Variant Surveillance and Wastewater Epidemiology
Key Tools
| Tool | Purpose | Output | |------|---------|--------| | Pangolin | Lineage assignment from consensus | CSV with lineage + confidence | | Nextclade | Clade + QC + amino acid changes | TSV with quality flags | | Freyja | Wastewater lineage deconvolution | Lineage fractions per sample | | GISAID / outbreak.info | Lineage frequency tracking | Web API + download |
Pango Nomenclature
Root: A, B (early Wuhan) Sub-lineages: B.1
[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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