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bio-atac-seq-co-accessibility

DevOps e Infra Autor: bg-szy

Infer cis-regulatory connections (peak-to-peak co-accessibility) from scATAC-seq using Cicero, ArchR getCoAccessibility, or SCENIC+. Use when linking enhancer accessibility to promoter accessibility, identifying enhancer-gene pairs from chromatin alone (without paired RNA), running gene-regulatory inference combining ATAC + RNA, or comparing predicted regulatory contacts against Hi-C/Micro-C groun

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Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Verify before use:

  • R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters
  • Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures

If code throws unexpected errors, introspect the installed package and adapt rather than retrying

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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