bio-atac-seq-differential-accessibility

Name: bio-atac-seq-differential-accessibility
Rating: 5 (1 reviews)
Author: bg-szy

Find differentially accessible chromatin regions between conditions using DiffBind or DESeq2. Use when comparing chromatin accessibility between treatment groups, cell types, or developmental stages in ATAC-seq experiments.

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Atualizado há 18 dias

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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Reference examples tested with: DESeq2 1.42+, GenomicRanges 1.54+, Subread 2.0+, numpy 1.26+, pandas 2.2+, scanpy 1.10+, scipy 1.12+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures
R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters
CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeErr

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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