bio-atac-seq-footprinting

Name: bio-atac-seq-footprinting
Rating: 5 (1 reviews)
Author: bg-szy

Detect transcription factor binding footprints in ATAC-seq using TOBIAS, HINT-ATAC, Wellington, or scprinter. Use when identifying bound TF sites within accessible regions, correcting Tn5 insertion bias before footprinting, choosing between cleavage-based and aggregate-based footprinters, or comparing differential TF activity between conditions.

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Atualizado há 18 dias

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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures
CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws unexpected errors, introspect the installed package and a

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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