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bio-causal-genomics-mediation-analysis

Desenvolvimento Autor: bg-szy

Decompose total effects into direct and indirect paths through mediators using mediation, CMAverse 4-way, HIMA/HIMA2 high-dimensional, BAMA, two-step / MVMR mediation, or double-ML medDML. Use when testing whether a molecular phenotype (expression, methylation, protein) mediates a treatment-outcome relationship, decomposing exposure-mediator interaction via VanderWeele 4-way, screening high-dimens

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Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Version Compatibility

Reference examples tested with: R 4.3+, mediation 4.5.0+, CMAverse 0.1.0+ (GitHub BS1125/CMAverse), HIMA >= 2.3.0 (CRAN), bama 1.3+, causalweight 1.0.5+ (medDML), MVMR 0.4+, TwoSampleMR 0.6+, EValue 4.1+, gesttools 1.3+, ipw 1.0.11+.

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters
  • HIMA must be pinned at >= 2.3.0 for the code patterns below; the formula inter

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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