bio-causal-genomics-mendelian-randomization

Name: bio-causal-genomics-mendelian-randomization
Author: bg-szy

Desenvolvimento

Autor: bg-szy

Estimate causal effects of an exposure on an outcome from GWAS summary statistics using genetic instruments. Implements IVW (fixed/random), MR-Egger, weighted median/mode, MR-RAPS, CAUSE, GSMR-HEIDI, MR-PRESSO, MVMR, MR-Clust, LCV, and LHC-MR via TwoSampleMR, MendelianRandomization, MR-PRESSO, cause, and lhcMR. Use when testing causal direction between traits, evaluating drug-target effects via ci

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Reference examples tested with: TwoSampleMR 0.6.0+, MendelianRandomization 0.10+, MR-PRESSO 1.0+, cause 1.2+, MVMR 0.4+, ieugwasr 1.0+, MRlap 0.0.3.2+, coloc 5.2+, mrclust 0.1+, lhcMR 0.0.1+, R 4.4+. Both TwoSampleMR 0.6.0 and ieugwasr 1.0 are the JWT-transition versions; older versions still expect deprecated OAuth.

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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