bio-chipseq-allele-specific-binding

Name: bio-chipseq-allele-specific-binding
Author: bg-szy

Desenvolvimento

Autor: bg-szy

Detects allele-specific transcription factor or histone modification binding from heterozygous-variant ChIP-seq using WASP (reference-bias filter; mandatory upstream), RASQUAL (joint QTL + bias-corrected testing), BaalChIP (Bayesian beta-binomial with copy-number-aware overdispersion), and AlleleSeq (personalized diploid genome). Handles imprinted-locus awareness, X-inactivation artifacts, cancer

2estrelas

Atualizado há 4 meses

Ver no GitHub ↗

Como adicionar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

Para o autor da skill

Cole no README do seu repo

Mostra que sua skill está catalogada na Skillteca, gera backlink e tráfego rastreável.

[![Skillteca](https://www.skillteca.com.br/api/badge/bio-chipseq-allele-specific-binding/svg)](https://www.skillteca.com.br/skills/bio-chipseq-allele-specific-binding)

#test

Skills relacionadas

Ver todas de Desenvolvimento →

claude-api

153.1k

Build, debug, and optimize Claude API / Anthropic SDK apps. Apps built with this skill should include prompt caching. Also handles migrating existing Claude API code between Claude model versions (4.5 → 4.6, 4.6 → 4.7, retired-model replacements). TRIGGER when: code imports `anthropic`/`@anthropic-ai/sdk`; user asks for the Claude API, Anthropic SDK, or Managed Agents; user adds/modifies/tunes a C

Desenvolvimento #ai #api por anthropics

skill-creator

153.1k

Crie novas skills, modifique e aprimore as existentes, e meça seu desempenho. Utilize para desenvolver, editar, otimizar, testar e comparar skills, além de refinar suas descrições para maior precisão de acionamento.

Desenvolvimento #test por anthropics

claude-code-plugin-release

83.4k

Fluxo de trabalho automatizado de versionamento semântico e lançamento para plugins do Claude Code. Gerencia incrementos de versão em manifestos package.json, marketplace.json, plugin.json, publicação npm (para que npx claude-mem@X.Y.Z seja resolvido), verificação de build, marcação git, lançamentos no GitHub e geração de changelog.

Desenvolvimento #ai #git por thedotmack

claude-mem

83.4k

Contexto Persistente Entre Sessões para Cada Agente – Captura tudo o que seu agente faz durante as sessões, comprime com IA e injeta contexto relevante de volta em sessões futuras. Compatível com Claude Code, OpenClaw, Codex, Gemini, Hermes, Copilot, OpenCode e mais.

Desenvolvimento #ai por thedotmack

Alerta por categoria

Receba novas skills de Desenvolvimento toda segunda

1 email curto, só com as skills novas de Desenvolvimento. 4 minutos de leitura, sem spam, cancela com 1 clique.

Você confirma o email no primeiro envio. Sem spam. Cancela com 1 clique.

Ler descrição completa

Version Compatibility

Reference examples tested with: WASP 0.3.4+, RASQUAL 1.1+, BaalChIP 1.30+ (Bioconductor), AlleleSeq 2.0+, samtools 1.19+, bcftools 1.19+, GATK 4.5+, pysam 0.22+.

Allele-Specific Binding (ASB)

"Identify variants that affect transcription factor or histone modification binding in cis" -> Compare ChIP-seq read counts at the reference and alternate alleles of heterozygous variants in a single sample. Differential read counts (ALT vs REF at hetSNPs in peaks) reveal a

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

Compartilhar X LinkedIn