bio-chipseq-super-enhancers

Name: bio-chipseq-super-enhancers
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Identifies super-enhancers from H3K27ac ChIP-seq data using ROSE and related tools. Use when studying cell identity genes, cancer-associated regulatory elements, or master transcription factor binding regions that cluster into large enhancer domains.

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Reference examples tested with: GenomicRanges 1.54+, bedtools 2.31+, ggplot2 3.5+, samtools 1.19+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters
CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retryi

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