bio-clip-seq-clip-motif-analysis

Name: bio-clip-seq-clip-motif-analysis
Author: bg-szy

DevOps e Infra

Autor: bg-szy

Discover RBP binding motifs from CLIP-seq peaks or single-nucleotide crosslink sites using HOMER, MEME/STREME, kpLogo, mCross (CL-position-registered motifs), PEKA (positional k-mer enrichment), RBPamp (affinity), and RNA Bind-n-Seq (RBNS) cross-validation. Use when characterizing RBP sequence specificity, registering motifs to crosslink positions, validating in vivo CLIP motifs against in vitro R

2estrelas

Atualizado há 4 meses

Ver no GitHub ↗

Como adicionar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

Para o autor da skill

Cole no README do seu repo

Mostra que sua skill está catalogada na Skillteca, gera backlink e tráfego rastreável.

[![Skillteca](https://www.skillteca.com.br/api/badge/bio-clip-seq-clip-motif-analysis-bg-szy/svg)](https://www.skillteca.com.br/skills/bio-clip-seq-clip-motif-analysis-bg-szy)

#ai

Skills relacionadas

Ver todas de DevOps e Infra →

internal-comms

153.1k

Recursos para auxiliar na redação de comunicações internas em diversos formatos preferidos pela empresa. Claude deve usar esta habilidade para criar relatórios de status, atualizações de liderança, newsletters, FAQs e outros documentos internos.

DevOps e Infra por anthropics

smart-explore

83.4k

Busca estrutural de código otimizada por tokens usando parsing AST do tree-sitter. Utilize para entender a estrutura do código, encontrar funções ou explorar uma base de código de forma eficiente, sem a necessidade de ler arquivos completos.

DevOps e Infra #ai por thedotmack

babysit

83.4k

Monitora um pull request ou ciclo de revisão até que esteja pronto para ser mesclado. Ideal para acompanhar comentários, revisões e CI de PRs até a resolução de todos os problemas.

DevOps e Infra #ai por thedotmack

do

83.4k

Execute um plano de implementação faseado usando subagentes. Use quando solicitado a executar, rodar ou levar a cabo um plano — especialmente um criado por make-plan.

DevOps e Infra #ai por thedotmack

Alerta por categoria

Receba novas skills de DevOps e Infra toda segunda

1 email curto, só com as skills novas de DevOps e Infra. 4 minutos de leitura, sem spam, cancela com 1 clique.

Você confirma o email no primeiro envio. Sem spam. Cancela com 1 clique.

Ler descrição completa

Version Compatibility

Reference examples tested with: HOMER 4.11+, MEME Suite 5.5+ (STREME, MEME-ChIP, FIMO), bedtools 2.31+, kpLogo 1.1+, mCross v1+, PEKA v1+, RBPamp 0.9+, ggseqlogo 0.1+, biopython 1.83+.

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags
Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures

If code throws unexpected errors, introspect the installed too

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

Compartilhar X LinkedIn