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bio-clip-seq-clip-peak-calling

Dados e Análise Autor: bg-szy

Call protein-RNA binding site peaks from CLIP-seq data using CLIPper, PureCLIP, or Piranha. Use when identifying RBP binding sites from aligned CLIP reads.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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This file is part of the "Universal Biomedical Skills" project.

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Provenance: Authenticated by MD BABU MIA

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CLIP-seq Peak Calling

CLIPper (Recommended)

# Basic peak calling
clipper \
    -b deduped.bam \
    -s hg38 \
    -o peaks.bed \
    --s

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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