bio-comparative-genomics-whole-genome-duplication

Name: bio-comparative-genomics-whole-genome-duplication
Author: bg-szy

Pesquisa e Web

Autor: bg-szy

Detect, date, and contextualize whole-genome duplication (WGD / paleopolyploidy) events using wgd v2 (Chen & Zwaenepoel 2024), KsRates (Sensalari 2022 substitution-rate-corrected Ks dating), DupGen_finder (Qiao 2019), MAPS (Li 2018 phylogenomic), POInT (Conant 2008 ordered-block), SLEDGe (2024 ML-based), Whale.jl (Bayesian DTL+WGD), and synteny-anchored paranome construction. Use when identifying

2estrelas

Atualizado há 4 meses

Ver no GitHub ↗

Como adicionar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

Para o autor da skill

Cole no README do seu repo

Mostra que sua skill está catalogada na Skillteca, gera backlink e tráfego rastreável.

[![Skillteca](https://www.skillteca.com.br/api/badge/bio-comparative-genomics-whole-genome-duplication/svg)](https://www.skillteca.com.br/skills/bio-comparative-genomics-whole-genome-duplication)

Skills relacionadas

Ver todas de Pesquisa e Web →

understand-domain

64.4k

Extrai conhecimento do domínio de negócio de uma base de código e gera um grafo interativo de fluxo de domínio. Funciona de forma autônoma (varredura leve) ou deriva de um grafo de conhecimento /understand existente.

Pesquisa e Web #ai por Lum1104

understand-dashboard

64.4k 2

Lance o painel web interativo para visualizar o grafo de conhecimento de uma base de código.

Pesquisa e Web por Lum1104

understand-chat

64.4k

Use quando precisar fazer perguntas sobre uma base de código ou entender código usando um grafo de conhecimento.

Pesquisa e Web por Lum1104

dev-browser

63k

Automatiza interações do navegador com estado de página persistente. Utilize para navegar em sites, preencher formulários, tirar capturas de tela, extrair dados da web, testar aplicativos ou automatizar fluxos de trabalho do navegador.

Pesquisa e Web #test por code-yeongyu

Alerta por categoria

Receba novas skills de Pesquisa e Web toda segunda

1 email curto, só com as skills novas de Pesquisa e Web. 4 minutos de leitura, sem spam, cancela com 1 clique.

Você confirma o email no primeiro envio. Sem spam. Cancela com 1 clique.

Ler descrição completa

Version Compatibility

Reference examples tested with: wgd v2.0.31+ (heche-psb/wgd; Chen & Zwaenepoel 2024 Bioinformatics 40:btae272), KsRates 1.1.3+ (VIB-PSB/ksrates; Sensalari 2022 Bioinformatics 38:530), DupGen_finder (Qiao 2019 Genome Biol 20:38), MAPS 1.0 (Li 2018), POInT (Conant lab), SLEDGe (bioRxiv 2024.01.17.574559), Whale.jl 2.0+, ksrates pip 1.1+, MCScanX 1.0+, PAML 4.10+ (yn00/codeml for Ks), BLAT 36+, DIAMOND 2.1+, R 4.4+, mclust 6.1+ (for mixture models). Python 3.10+ required f

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

Compartilhar X LinkedIn