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bio-core-comparative-genomics

Gráficos de pontos, análise de sintenia, detecção de rearranjos genômicos, distinção entre ortólogos/parálogos, conceitos de pan-genoma e seleção de ferramentas para alinhamento de genomas pareados.

3estrelas
Atualizado há 6 meses

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Como adicionar

/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

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When to Use

  • Visualising sequence similarity and structural rearrangements (dot plots)
  • Detecting conserved gene order between species (synteny blocks)
  • Identifying inversions, translocations, duplications from genome alignments
  • Choosing a whole-genome alignment tool

Key Concepts

Ortholog vs. paralog: Orthologs diverged via speciation (same function across species). Paralogs diverged via duplication (may gain new functions). Reliable ortholog inference requires sequence similari

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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