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bio-core-computational-genetics

Design e Frontend Autor: Pavel-Kravchenko

Construa programaticamente o código genético padrão e traduza DNA para proteína. Compreenda a degenerescência do códon, calcule estatísticas de uso de códons (RSCU, CAI) e realize digestões virtuais com enzimas de restrição.

3estrelas
Atualizado há 6 meses
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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

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Computational Genetics

Key Concepts

  • Degeneracy vs. synonymous: Four-fold degenerate sites (e.g., Pro: CCN) are effectively neutral; two-fold degenerate sites have one constrained position. All synonymous codons encode the same AA but not all positions are equally degenerate.
  • CAI reference set: CAI measures codon adaptation relative to a reference set of highly expressed genes. Wrong organism or non-HEG reference gives misleading values; use ribosomal protein or metabolic genes

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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