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bio-ecological-genomics-landscape-genomics

Design e Frontend Autor: bg-szy

Tests genotype-environment associations and identifies adaptive loci while correcting for the four-confound landscape (structure, demography, background selection, sampling design) using LFMM2 with mandatory K via sNMF cross-entropy elbow (LEA 3), BayPass Core/AUX/C2/IS with Omega covariance matrix, RDA / pRDA for polygenic adaptation (Forester 2018; requires imputed genotypes), OutFLANK with trim

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Atualizado há 4 meses
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Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters
  • CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed packa

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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