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bio-ensembl-rest

Dados e Análise Autor: bg-szy

Query the Ensembl REST API for gene/transcript/protein lookup, sequence retrieval, comparative genomics (Compara), variant effect prediction (VEP), regulatory features, and cross-species ortholog/paralog calls. Use when pulling Ensembl-native data (Ensembl Gene IDs, version-pinned releases, archive endpoints for reproducibility), gene/transcript/exon structure with stable IDs, or VEP for variant a

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Atualizado há 4 meses
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#api

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Version Compatibility

Reference examples tested with: requests 2.31+, Ensembl REST API (release 110+); Ensembl release schedule is roughly quarterly

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • Python: pip show requests
  • API surface: check release notes at https://rest.ensembl.org

Each Ensembl release has an archive REST endpoint (e.g. https://e110.rest.ensembl.org) for reproducibility.

Ensembl REST

**"Pull Ensembl-native gene / transcript / v

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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