bio-entrez-fetch

Name: bio-entrez-fetch
Author: bg-szy

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Autor: bg-szy

Retrieve records from NCBI databases using Biopython Bio.Entrez (EFetch, ESummary). Use when downloading sequences, fetching GenBank/GenPept records, getting document summaries, parsing nested XML, navigating GI deprecation, choosing between rettype+retmode combinations, and parsing into Biopython SeqRecord/SwissProt objects. Covers nucleotide, protein, gene, pubmed, sra, gds, taxonomy, snp, clinv

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Version Compatibility

Reference examples tested with: BioPython 1.83+, Entrez Direct 21.0+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

Python: pip show biopython then help(Bio.Entrez.efetch) to check signatures
CLI: efetch -version then efetch -help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Entrez Fetch

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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