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bio-epidemiological-genomics-amr-surveillance

Pesquisa e Web Autor: bg-szy

Detect and track antimicrobial resistance genes using AMRFinderPlus and ResFinder with epidemiological context. Monitor resistance trends and identify emerging resistance patterns. Use when screening genomes for AMR genes or tracking resistance in surveillance programs.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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Version Compatibility

Reference examples tested with: AMRFinderPlus 3.12+, pandas 2.2+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures
  • CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

AMR Surveillance

**

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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