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bio-epidemiological-genomics-variant-surveillance

Pesquisa e Web Autor: bg-szy

Assign pathogen lineages and track variants using Nextclade and pangolin for viral surveillance. Monitor variant prevalence and identify emerging variants of concern. Use when classifying viral sequences, tracking lineage dynamics, or monitoring for variants of concern.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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Version Compatibility

Reference examples tested with: Nextclade 3.3+, ggplot2 3.5+, pandas 2.2+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures
  • CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Variant Sur

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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