bio-experimental-design-multiple-testing

Name: bio-experimental-design-multiple-testing
Author: bg-szy

Desenvolvimento

Autor: bg-szy

Controls error rates across thousands of simultaneous tests in genomics discovery using false-discovery-rate methods (Benjamini-Hochberg 1995; Benjamini-Yekutieli 2001 for arbitrary dependence; Storey q-value with pi0 estimation; local FDR; independent filtering Bourgon 2010; covariate-weighted FDR via IHW Ignatiadis 2016), plus family-wise error control (Bonferroni, Holm) and the GWAS genome-wide

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Version Compatibility

Reference examples tested with: qvalue 2.34+, IHW 1.30+, R stats (base) p.adjust, statsmodels 0.14+, scipy 1.12+.

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters
Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures

If code throws an error, introspect the installed package and adapt to the actual API. Note: `statsmodels.stats.multitest.m

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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