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bio-expression-matrix-metadata-joins

Dados e Análise Autor: bg-szy

Aligns sample metadata with count matrices and constructs design matrices for downstream DE, handling the alphabetical-reference-level trap (relevel BEFORE DESeq), LRT reduced-model rules, the interaction-term resultsNames trap, continuous-covariate scaling and splines, repeated measures via duplicateCorrelation or dream, high-cardinality categorical pseudo-singular designs, sample swap detection

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters
  • Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures
  • CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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