bio-flow-cytometry-clustering-phenotyping

Name: bio-flow-cytometry-clustering-phenotyping
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Unsupervised clustering and cell type identification for flow/mass cytometry. Covers FlowSOM, Phenograph, and CATALYST workflows. Use when discovering cell populations in high-dimensional cytometry data without predefined gates.

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Atualizado há 4 meses

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Version Compatibility

Reference examples tested with: FlowSOM 2.10+, scanpy 1.10+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Clustering and Phenotyping

"Cluster my cytometry data to find cell types" → Discover cell

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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