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bio-gene-regulatory-networks-coexpression-networks

Design e Frontend Autor: bg-szy

Build weighted gene co-expression networks to identify modules of co-regulated genes, relate them to phenotypes, and find hub genes using WGCNA, hdWGCNA, MEGENA, CEMiTool, and Gaussian graphical models. Covers signed-network choice, soft-threshold selection, module preservation, and the marginal-vs-partial-correlation distinction. Use when finding co-expression modules, identifying hub genes, rela

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Atualizado há 4 meses
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Reference examples tested with: WGCNA 1.72+, hdWGCNA 0.3+, CEMiTool 1.26+, GENIE3-adjacent GGM via GeneNet 1.2.16+.

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

  • R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters
  • Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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