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bio-genome-assembly-hifi-assembly

Dados e Análise Autor: bg-szy

High-quality genome assembly from PacBio HiFi reads using hifiasm with phasing support. Use when building reference-quality diploid assemblies from HiFi data, especially with trio or Hi-C phasing for fully resolved haplotypes.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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This file is part of the "Universal Biomedical Skills" project.

Copyright (c) 2026 MD BABU MIA, PhD <md.babu.mia@mssm.edu>

All Rights Reserved.

#

This code is proprietary and confidential.

Unauthorized copying of this file, via any medium is strictly prohibited.

#

Provenance: Authenticated by MD BABU MIA

-->

HiFi Assembly

Basic Assembly

# Primary assembly (single haplotype consensus)
hifiasm -o output_prefix -t 32 reads.hifi.fastq.gz

# Outpu

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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