bio-isoform-switching

Name: bio-isoform-switching
Author: bg-szy

Desenvolvimento

Autor: bg-szy

Analyzes isoform switching events and functional consequences using IsoformSwitchAnalyzeR. Predicts protein domain changes, NMD sensitivity, ORF alterations, and coding potential shifts between conditions. Use when investigating how splicing changes affect protein function.

2estrelas

Atualizado há 4 meses

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Reference examples tested with: Salmon 1.10+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

R: packageVersion('<pkg>') then ?function_name to verify parameters

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Isoform Switching Analysis

Identify isoform switches and predict their functional consequences on protein str

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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