bio-longread-alignment

Name: bio-longread-alignment
Author: bg-szy

Marketing

Autor: bg-szy

Align long reads using minimap2 for Oxford Nanopore and PacBio data. Supports various presets for different read types and applications. Use when aligning ONT or PacBio reads to a reference genome for variant calling, SV detection, or coverage analysis.

2estrelas

Atualizado há 4 meses

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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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Version Compatibility

Reference examples tested with: minimap2 2.26+, samtools 1.19+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Long-Read Alignment with minimap2

"Align my long reads to the reference" → Map ONT or PacBio read

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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