bio-longread-medaka

Name: bio-longread-medaka
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Polish assemblies and call variants from Oxford Nanopore data using medaka. Uses neural networks trained on specific basecaller versions. Use when improving ONT-only assemblies or calling variants from Nanopore data without short-read polishing.

2estrelas

Atualizado há 4 meses

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Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

CLI: <tool> --version then <tool> --help to confirm flags

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Medaka Polishing and Variant Calling

"Polish my ONT assembly with medaka" → Use n

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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