bio-machine-learning-atlas-mapping

Name: bio-machine-learning-atlas-mapping
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Maps query single-cell data to reference atlases using scArches transfer learning with scVI and scANVI models. Transfers cell type labels without retraining on combined data. Use when annotating new single-cell datasets using pre-trained reference models.

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Atualizado há 4 meses

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Version Compatibility

Reference examples tested with: anndata 0.10+, scanpy 1.10+, scvi-tools 1.1+

Before using code patterns, verify installed versions match. If versions differ:

Python: pip show <package> then help(module.function) to check signatures

If code throws ImportError, AttributeError, or TypeError, introspect the installed package and adapt the example to match the actual API rather than retrying.

Transfer Learning for Single-Cell Data

**"Map my scRNA-seq data onto a

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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